Reakce na daňové kontroly u neziskových organizací:

Řídíte neziskovou organizaci a čelíte hrozbě daňové kontroly? Riziko doměření daně a krácení dotací je vysoké. Tento článek vám poskytne srozumitelný návod, jak se bránit v každé fázi kontroly a ochránit tak finance i poslání vaší organizace.

Autor článku: ARROWS advokátní kancelář (JUDr. Jakub Dohnal, Ph.D., LL.M., office@arws.cz, +420 245 007 740)

Proč se finanční úřad zajímá právě o vaši neziskovou organizaci?

Představa, že si finanční úřad vybírá organizace ke kontrole náhodně, je mylná. 

Ve skutečnosti je daňová kontrola téměř vždy výsledkem cílené analýzy nebo konkrétního podnětu. Správce daně nemusí důvod zahájení kontroly sdělovat, ale nejčastěji za ním stojí jeden ze tří hlavních spouštěčů: podnět zvenčí (například od nespokojeného bývalého zaměstnance), vlastní analytická činnost úřadu, která odhalí nesrovnalosti ve vašich výkazech, nebo sektorové zaměření na kontrolu neziskových organizací jako celku.

Největší riziko pro neziskové organizace přitom nespočívá v úmyslném krácení daní, ale v neúmyslných chybách plynoucích ze složitého právního rámce. 

Klíčovým a nejčastěji kontrolovaným bodem je správné rozlišení mezi hlavní (nepodnikatelskou) činností a hospodářskou (vedlejší) činností. Právě zde vzniká nejvíce nejasností, které mohou vést k doměření daně.

Zákon o daních z příjmů totiž stanoví, že pokud je vaše hlavní, nepodnikatelská činnost ztrátová, příjmy z ní nejsou předmětem daně. Pokud však některá část vaší hlavní činnosti vygeneruje zisk (například benefiční ples nebo prodej výrobků v rámci charitativní akce), mohou být tyto příjmy posouzeny jako zdanitelné, i když celkově je hlavní činnost ve ztrátě.

Zatímco dotace a dary jsou zpravidla od daně z příjmů osvobozeny, příjmy z reklam, nájemného nebo některých členských příspěvků jsou naopak předmětem daně vždy. Správné nastavení vnitřních procesů a stanov je proto naprosto zásadní.

Právníci ARROWS pravidelně pomáhají neziskovým organizacím správně nastavit jejich vnitřní procesy a stanovy, aby se předešlo chybné klasifikaci příjmů a souvisejícím rizikům.

Jak probíhá daňová kontrola krok za krokem? Průvodce pro vedení NPO.

Proces daňové kontroly se řídí přísnými pravidly stanovenými v daňovém řádu (zákon č. 280/2009 Sb.) a je důležité znát jeho jednotlivé fáze, svá práva i povinnosti. Porozumění tomuto procesu vám umožní lépe se připravit a efektivněji reagovat na kroky správce daně.

Kontrola formálně začíná doručením dokumentu nazvaného Oznámení o zahájení daňové kontroly. Tento okamžik je strategicky klíčový. Jakmile je daňová kontrola zahájena, ztrácíte právo podat dodatečné daňové přiznání a sami tak opravit případné chyby z minulosti. Tím se situace zásadně mění – z možnosti proaktivní nápravy se stává proces, kde musíte obhajovat své kroky před správcem daně.

V průběhu kontroly je správce daně oprávněn požadovat předložení veškeré relevantní dokumentace, účetních záznamů, smluv a dalších podkladů. Může také vést jednání s vašimi zaměstnanci či dalšími osobami, které pro vaši organizaci vykonávají činnost. Vaší základní povinností je poskytovat součinnost a nezatajovat důkazní prostředky.

Zároveň však máte svá práva. Mezi ta nejdůležitější patří právo být přítomen jednání se zaměstnanci, navrhovat a předkládat důkazní prostředky na podporu svých tvrzení a vyvracet pochybnosti správce daně. Klíčové je si uvědomit, že důkazní břemeno leží na vás – vy musíte prokázat všechny skutečnosti, které uvádíte ve svém daňovém přiznání a dalších podáních.

Tento proces může být pro vedení organizace časově i psychicky nesmírně náročný. Právníci ARROWS mohou převzít kompletní komunikaci s finančním úřadem, zajistit, aby byly předloženy pouze relevantní dokumenty, a aktivně bránit vaše práva v každé fázi kontroly, čímž vám uvolní ruce pro řízení vaší organizace.

Nevíte si s daným tématem rady?

Zkušenosti z desítek kontrol u neziskových organizací ukazují, že největší hrozby se opakují. Jde především o chyby v klasifikaci příjmů, nedostatky v účetnictví a neprokázání využití daňových úlev. Následující tabulka shrnuje nejčastější rizika a ukazuje, jak vám s nimi můžeme v ARROWS pomoci.

Riziko k řešení	Potenciální problémy a sankce	Jak pomáhá ARROWS:
Nesprávná klasifikace příjmů	Doměření daně z příjmů, které organizace považovala za nezdanitelné (např. zisková část hlavní činnosti). Penále.	Právní stanovisko ke klasifikaci příjmů a revize vnitřních účetních směrnic.
Chyby v účetnictví	Zpochybnění celého účetnictví, stanovení daně podle pomůcek, vysoké doměrky a sankce.	Právní konzultace pro zajištění souladu účetnictví se zákonem a daňovými předpisy.
Nedostatečné oddělení nákladů	Neuznání nákladů u zdanitelné činnosti, což vede k uměle vysokému základu daně a vyšší dani.	Vyhotovení interních směrnic pro alokaci a evidenci nákladů.
Neunesení důkazního břemene	Správce daně neuzná tvrzení organizace, doměří daň a uloží sankce.	Příprava kompletní dokumentace a argumentace pro prokázání všech tvrzení.
Chybné využití daňové úspory	Dodatečné zdanění částky, o kterou byl snížen základ daně (§ 20 odst. 7 ZDP), pokud není prokázáno její využití.	Právní poradenství při nastavení systému pro sledování a prokazování využití daňové úspory.
Formální pochybení ve stanovách	Zpochybnění statusu veřejně prospěšného poplatníka a ztráta všech daňových výhod.	Revize a úprava zakladatelských dokumentů pro zajištění souladu se ZDP.
Rizika u mezinárodních darů/grantů	Dvojí zdanění, problémy s prokázáním původu prostředků, neaplikování mezinárodních smluv.	Konzultace s využitím sítě ARROWS International pro správné daňové posouzení příjmů ze zahraničí.

Když kontrola míří na dotace: Hrozba krácení a vracení prostředků

Pro mnoho neziskových organizací je největší hrozbou spojenou s kontrolou riziko ztráty dotačních prostředků. Kontrola se často zaměřuje právě na čerpání dotací, ať už z národních, nebo evropských zdrojů. Zde se setkáváme s klíčovým pojmem: porušení rozpočtové kázně.

K porušení rozpočtové kázně dochází podle zákona o rozpočtových pravidlech (zákon č. 218/2000 Sb.) tehdy, když příjemce dotace neoprávněně použije nebo zadrží poskytnuté prostředky. V praxi to znamená použití peněz na jiný než stanovený účel, nedodržení podmínek smlouvy o poskytnutí dotace, nebo nesplnění termínů.

Důsledky jsou velmi vážné a mohou být pro organizaci likvidační. Patří mezi ně:

• Krácení dotace: Poskytovatel se rozhodne nevyplatit zbývající část přislíbených prostředků.
• Odvod za porušení rozpočtové kázně: Organizace je nucena vrátit část, nebo dokonce 100 % již obdržených peněz.
• Penále: K povinnosti vrátit prostředky se připočítává penále za každý den prodlení, které může dosáhnout až výše samotného odvodu.

Tato rizika se násobí v případě mezinárodních grantů, kde do hry vstupují i evropské předpisy a nově také možnost tzv. společných daňových kontrol více členských států EU najednou.

Díky deset let budované síti ARROWS International mají naši právníci praktické zkušenosti s řešením kontrol u dotací s mezinárodním prvkem a dokáží efektivně navigovat nejen v českém, ale i v evropském právu.

Strategie obrany proti krácení dotací: Jak chránit vaše financování?

I když se situace může zdát bezvýchodná, existují účinné obranné strategie. Poskytovatelé dotací a kontrolní orgány často chybují a jejich požadavky na vrácení prostředků nejsou vždy oprávněné. Klíčem k úspěšné obraně je znalost zákona a především relevantní judikatury správních soudů.

Strategie 1: Zpochybnění nejasných dotačních podmínek

Smlouvy o poskytnutí dotace jsou často formulovány vágně. Podle konstantní judikatury Nejvyššího správního soudu platí, že nejednoznačnost a neurčitost dotačních podmínek nikdy nemůže jít k tíži příjemce dotace, který je považován za slabší stranu. Tento právní princip, známý jako contra proferentem, je silným argumentem proti požadavkům založeným na nejasných ustanoveních smlouvy.

Strategie 2: Uplatnění principu proporcionality

Nejvyšší správní soud opakovaně potvrdil, že ne každé, byť sebemenší, porušení pravidel automaticky znamená povinnost vrátit 100 % dotace. Uložená sankce (odvod) musí být přiměřená závažnosti pochybení. Formální administrativní chyba, která neměla vliv na naplnění účelu projektu, nemůže být trestána stejně přísně jako úplné zmaření účelu dotace.

Obraťte se na naše odborníky:

Úspěšné uplatnění těchto strategií vyžaduje hlubokou znalost soudních rozhodnutí a zkušenosti s argumentací před správními orgány. 

Právníci ARROWS se specializují na argumentaci založenou na judikatuře Nejvyššího správního soudu a umí posoudit, zda je požadavek na vrácení dotace v souladu se zásadou proporcionality.

Riziko k řešení	Potenciální problémy a sankce	Jak pomáhá ARROWS:
Nejednoznačné dotační podmínky	Poskytovatel interpretuje vágní podmínky v neprospěch organizace, hrozí krácení či odvod.	Právní analýza smlouvy a argumentace proti poskytovateli na základě principu contra proferentem.
Nedodržení účelu dotace	Odvod 100 % poskytnutých prostředků a vysoké penále. Poškození reputace.	Zastupování u správních orgánů a příprava argumentace prokazující naplnění hlavního účelu projektu.
Formální pochybení (např. pozdní odevzdání zprávy)	Nepřiměřená sankce (např. 100% odvod) za administrativní chybu.	Příprava odvolání s argumentací porušení zásady proporcionality.
Problémy při zadávání veřejných zakázek	Zpochybnění způsobilosti výdajů, odvod ve výši 25 % - 100 % hodnoty zakázky.	Právní konzultace v průběhu výběrového řízení; zastupování v řízení o odvodu.
Nedostatečná dokumentace a archivace	Nemožnost prokázat oprávněnost výdajů, odvod za neprokázané náklady.	Příprava dokumentace a důkazních prostředků pro kontrolu.
Nesplnění indikátorů projektu	Krácení dotace v poměrné výši dle nesplněných cílů.	Právní stanovisko a vyjednávání s poskytovatelem o objektivních příčinách nesplnění.
Neoprávněné čerpání prostředků	Odvod v plné výši neoprávněně čerpaných prostředků, penále, v krajním případě trestní odpovědnost.	Zastupování u soudů a správních orgánů, příprava komplexní obhajoby.

Následky kontroly: Co dělat při doměření daně a uložení sankcí?

Pokud daňová kontrola odhalí pochybení, jejím výsledkem je Zpráva o daňové kontrole, na jejímž základě je následně vydán Platební výměr. 

Tento dokument oficiálně stanovuje doměřenou daň (doměrek) a související sankce, nejčastěji penále. Doručení platebního výměru však neznamená konec. Je to naopak signál k zahájení aktivní obrany.

Základním a nejdůležitějším opravným prostředkem je odvolání. Musí být podáno do 30 dnů od doručení platebního výměru. Je klíčové tuto lhůtu nepromeškat. 

Odvolací řízení představuje poslední příležitost, jak zvrátit negativní rozhodnutí v rámci Finanční správy a předložit nové argumenty a důkazy, než se případ přesune k soudu.

Nevíte si s daným tématem rady?

Kvalitně zpracované odvolání, které je postaveno na precizní právní argumentaci a podloženo relevantními důkazy, má vysokou šanci na úspěch. Pokud odvolání není úspěšné, další možností je obrátit se na soud prostřednictvím správní žaloby. 

ARROWS má rozsáhlé zkušenosti s přípravou odvolání a zastupováním klientů v odvolacím řízení i v následných soudních sporech. 

Nepodceňujte přípravu a mějte na své straně silného partnera

Daňová kontrola v neziskové organizaci je komplexní a stresující proces, který může ohrozit nejen finance, ale i samotné poslání vaší organizace. Jak jsme ukázali, klíčem k úspěchu je kombinace pečlivé prevence, znalosti vašich práv a povinností a včasné, odborně vedené obrany, pokud ke kontrole dojde.

Největší rizika plynou ze složitosti daňových předpisů a pravidel pro čerpání dotací. Okamžik zahájení kontroly je kritickým bodem, kdy se výrazně zužují vaše možnosti. Nečekejte, až se problém stane neřešitelným. 

V ARROWS jsme připraveni vám poskytnout podporu v každé fázi – od preventivní revize vašich procesů až po zastupování před finančními úřady a soudy. Zakládáme si na rychlosti a vysoké kvalitě našich služeb.

Čelíte daňové kontrole, nebo se na ni chcete připravit? Neřešte to sami. Obraťte se na náš tým specialistů v ARROWS. Pomůžeme vám ochránit vaši organizaci, její finance i její poslání. Kontaktujte nás ještě dnes pro úvodní konzultaci.

Nechcete tenhle problém řešit sami? Advokátní kanceláři ARROWS věří více než 2000 klientů a jsme oceněni jako Právnická firma roku 2024. Podívejte se ZDE na naše reference a bude nám ctí pomoci vám při řešení vašeho problému. Poptávka je zdarma.