Daňová kontrola 2026: Jak se připravit na digitalizaci finanční správy

V roce 2026 se daňové kontroly zásadně mění. Digitalizace finanční správy znamená, že každá vaše firemní transakce může být podrobena automatické analýze. Pokud jste majitel společnosti nebo vrcholový manažer, zde najdete konkrétní a odborné odpovědi na otázky, jak se na tuto novou realitu efektivně připravit, minimalizovat rizika pokut a zajistit, že vaše korporace je plně compliant.

Potřebujete s tématem poradit? Obraťte se na advokátní kancelář ARROWS na e-mail office@arws.cz nebo telefon +420 245 007 740. Váš dotaz rád zodpoví "JUDr. Jakub Dohnal, Ph.D.,LL.M.", expert na dané téma.

Digitalizace daní mění pravidla hry: Od háhodných kontrol k datové analýze

Finanční správa (FS) aktivně posiluje svou analytickou kapacitu, přičemž se stále více spoléhá na nástroje pro analýzu velkých objemů dat (big data). Cílem je identifikovat nejpravděpodobnější daňové úniky a rizikové subjekty. To v praxi znamená, že daňová kontrola, která k vám dorazí, již nebude výsledkem náhody, ale extrémně cílené analýzy podložené rozsáhlým datovým modelem.

Důsledkem tohoto posunu je, že FS již disponuje dostatečnými informacemi k detekci nesrovnalostí, a zaměřuje se tak na efektivnější vymáhání daní. Sekce výkonu daní, která tyto datové analýzy řídí, se zabývá odhalováním rizikových subjektů.

Jako součást nového přístupu začala FS využívat neformální mechanismy upozornění. Tzv. „listové kampaně“ jsou doručovány do datových schránek a dávají poplatníkům šanci napravit zjištěné chyby bez okamžité sankce.

Tento přístup ze strany Finanční správy ukazuje, že již disponuje dostatečnými daty k detekci nesrovnalostí; pokud obdržíte upozornění, vaše společnost je již v hledáčku analytiků, a je proto nezbytné jednat okamžitě. 

Naši právníci z advokátní kanceláře ARROWS mají rozsáhlé zkušenosti s jednáním se správcem daně v takových případech, kdy je nutné zabránit eskalaci do formální daňové kontroly. Pro okamžité řešení vaší situace nám napište na office@arws.cz.

FS se v rámci svých datových analýz soustředí například na nesprávně uplatněné daňové úlevy nebo na transakce mezi spojenými osobami (kapitálově nebo personálně provázané firmy). Tyto transakce byly v minulosti zneužívány k daňovým únikům, a proto vyžadují zvýšenou dokumentační obezřetnost.

Důsledky pro korporátní odpovědnost a dokumentaci

Základní povinností každé obchodní společnosti je vést účetnictví tak, aby bylo průkazné, správné a úplné. Digitalizace tuto povinnost rozšiřuje i na digitální archivy a datové toky, které musí být nejen bezchybné, ale především lehce auditovatelné a strojově zpracovatelné.

Mnoho firem se zbytečně obává zavádění digitálních nástrojů, a to kvůli mýtu o jejich vysoké nákladovosti a časové náročnosti. Neinvestování do digitalizace interních procesů a dokumentace však vede k vyšším rizikům a následně i k vyšším sankcím při kontrole.

Digitalizace na straně FS znamená, že požadavek na průkaznost se stává absolutním standardem. Pokud nebudete schopni požadovaná data a podklady rychle a standardizovaně dodat, Finanční správa může daň doměřit na základě úředního odhadu, což zpravidla není pro kontrolovaný subjekt výhodné.

Advokátní kancelář ARROWS vám nabízí přípravu dokumentace, smluv, směrnic, či jiných, které ochrání před pokutami a sankcemi, a zajistí tak soulad s přísnými požadavky.

Pro úplný přehled o této službě navštivte naši stránku ZDE.

FAQ – Právní tipy k datové analýze FS

1. Jak Finanční správa detekuje rizikové transakce?
Využívá analytické nástroje a křížovou kontrolu dat z Kontrolních hlášení, bankovních záznamů a mezinárodní výměny informací. Potřebujete právní pomoc? Kontaktujte nás na office@arws.cz.

2. Můžeme se chránit před digitálním označením za rizikový subjekt?
Ano, klíčová je proaktivní compliance a implementace interních systémů pro řízení daňových rizik (TCMS). Získejte právní řešení na míru – spojte se s námi na office@arws.cz.

Klíčový prvek prevence: Standard Audit File for Tax (SAF-T) a TCMS

Zvyšující se globální trend ve správě daní, podpořený Organizací pro hospodářskou spolupráci a rozvoj (OECD), směřuje k zavedení mezinárodního standardu nazvaného Standard Audit File for Tax (SAF-T). Jedná se o strukturovaný soubor pro elektronickou výměnu účetních a daňových dat. Tento soubor typicky zahrnuje transakční data, jako jsou faktury a účtenky, záznamy hlavní knihy a další finanční informace.

Pro korporace s mezinárodní působností je příprava na SAF-T již nyní kritická. I když Česká republika zatím neimplementovala SAF-T plošně, nadnárodní společnosti musí být připraveny data v takovém formátu poskytnout. Důležitým faktorem je, že ačkoliv se SAF-T prezentuje jako standard, konkrétní požadavky na data se v jednotlivých zemích často liší, což představuje významnou komplexitu pro subjekty, které operují v mnoha jurisdikcích.

Pokud firma není schopna na žádost kontrolního orgánu poskytnout data ve snadno strojově zpracovatelném formátu, může to vést k prodlevám, chybám a prodloužení kontrolního řízení. Právníci ARROWS vám proto pomohou s přípravou podkladů stanovených zákonem tak, aby odpovídaly moderním digitálním požadavkům, a vyhnuli jste se problémům s průkazností dat.

Nezbytnost Tax Compliance Management systému (TCMS)

Jako reakce na rostoucí komplexitu daňové legislativy a digitální požadavky se prosazuje Tax Compliance Management Systém (TCMS). TCMS představuje soubor principů, postupů a opatření, které jsou zásadní pro splnění daňových povinností firmy a prevenci porušování daňových zákonů.

TCMS není jen administrativní zátěž. Je to strategický nástroj. Organizuje interní řízení tak, aby bylo možné identifikovat, posoudit a mapovat daňové riziko. Důležité součásti TCMS zahrnují definování cílů, rolí a odpovědností, tvorbu dokumentace procesů (např. Risk Control Matrix), a průběžné monitorování. Systém tak signalizuje správním orgánům, že firma má kontrolu nad svými daňovými povinnostmi.

Zavedení TCMS přináší i hmatatelné výhody v podobě snížení manuálního zpracování dat, minimalizace chyb a rychlé reakce na legislativní změny.

Právní agenda spojená s implementací TCMS je náročná na detaily a vyžaduje hlubokou znalost daňového řádu i firemních procesů. Naši právníci proto běžně poskytují právní konzultace, které chrání před pokutami a kontrolami, a aktivně pomáhají s nastavením celého TCMS.

FAQ – Právní tipy k TCMS

1. Jaký je největší přínos TCMS?
Největším přínosem je minimalizace chyb a systematické řízení daňových rizik, které vede k úspoře nákladů a času. Chcete zjistit, jak TCMS implementovat? Napište nám na office@arws.cz.

2. Pomáhá TCMS i s DAC6?
Ano, TCMS zahrnuje procesní dokumentaci, která by měla zajistit včasné a správné plnění oznamovacích povinností daných DAC6. Získejte právní řešení na míru – spojte se s námi na office@arws.cz.

Komplexnost, kterou laik nevidí: Důkazní břemeno a zneužití práva

Při daňové kontrole je rozhodující, že důkazní břemeno ohledně správnosti tvrzených daňových povinností spočívá na daňovém subjektu. V digitální éře již nestačí mít doklady jen v šanonu. Digitalizace ze strany FS nutí firmy prokazovat pravdivost svých tvrzení pomocí rychle dostupných a ověřitelných digitálních dat.

Daňová problematika je v praxi složitější, než se na první pohled zdá. Proces daňové kontroly je detailně upraven Daňovým řádem. Zkušení právníci vědí, že zdánlivě jednoduché kroky, jako je reakce na výzvu k poskytnutí součinnosti, mají přísné lhůty a procedurální náležitosti. Jejich porušení může vést k pořádkovým pokutám, které mohou dosáhnout výše až 50 000 Kč.

S ohledem na složitost a možné právní výjimky, je pro firmy bezpečnější nechat prověrku a nastavení interních procesů zajistit právníky z ARROWS. Denně řešíme, jak zajistit soulad s předpisy, které mají skryté detaily a návaznosti na další právní normy, které laik často nevidí. Naši právníci zajistí, že neignorujete žádné povinnosti, protože neochota spolupracovat nebo nedodání dokumentů může vést k doměření daně s penále.

Generální pravidlo proti zneužívání (GAAR/ATAD)

Moderní daňová správa klade velký důraz na prevenci zneužívání práva. Český Daňový řád explicitně zakotvuje Generální pravidlo proti zneužívání daňového práva (GAAR), které vychází ze směrnice EU ATAD (Anti Tax Avoidance Directive).

Toto pravidlo je zásadní pro korporátní strategii, protože dává Finanční správě nástroj, jak neuznat daňové výhody plynoucí z transakcí, které byly strukturovány primárně za účelem získání daňové úlevy, nikoliv z legitimních obchodních důvodů. To se týká zejména komplexních transakcí, jako je prodej podílů nebo vyplácení příplatků mimo základní kapitál. Riziko, že dojde k aplikaci GAAR, může mít fatální daňové a finanční důsledky.

Základní rizika nedostatečné digitální připravenosti a jak pomáhá ARROWS

Rizika a sankce	Jak pomáhá ARROWS (Služba + CTA)
Neúplná nebo neprůkazná elektronická dokumentace, vedoucí k doměření daně.	Příprava podkladů stanovených zákonem – potřebujete mít dokumentaci v pořádku? Napište na office@arws.cz.
Zahájení kontrolního řízení kvůli algoritmickému označení společnosti jako rizikové.	Zastupování v sankčních a správních řízeních – potřebujete právní zastoupení? Kontaktujte nás na office@arws.cz.
Pořádkové pokuty (až 50 000 Kč) za nesplnění nepeněžitých povinností nebo neochotu spolupracovat.	Právní konzultace, které chrání před pokutami a kontrolami – chcete se vyhnout pokutám? Spojte se s námi na office@arws.cz.
Ztráta času manažerů nutná pro řešení požadavků kontrolorů a zajištění součinnosti.	Zajištění a organizace celého procesu daňové kontroly – chcete, aby proces proběhl hladce? Neváhejte se obrátit na naši kancelář – office@arws.cz.

Mezinárodní rozměry a globální opatrnost

Digitalizace daňové správy nemá pouze lokální rozměr, ale je intenzivně řízena mezinárodními a evropskými směrnicemi. Pro korporace, investory a majitele velkého majetku s mezinárodním přesahem je klíčové sledovat nové reportovací povinnosti.

Směrnice DAC6 zavedla povinnost ohlašování daňově relevantních přeshraničních uspořádání (transakcí), které splňují definované charakteristické znaky (tzv. hallmarks). Finanční správa ČR tak získává informace o transakcích, které by dříve zůstaly skryté, a může aktivně odhalovat daňové úniky.

Další směrnice, DAC7, umožňuje lepší daňovou kontrolu podnikání na digitálních platformách, což má dopad na subjekty využívající globální digitální trh nebo pronájmy nemovitostí prostřednictvím platforem.

Advokátní kancelář ARROWS zajišťuje právní služby mimo Českou republiku díky deset let budované síti ARROWS International a prakticky denně řešíme případy s mezinárodním prvkem, ať už jde o DAC6, TCMS nebo složité strukturování transakcí.

ARROWS jako partner pro mezinárodní transakce

Rizika spojená s digitalizací a mezinárodním reportingem se významně promítají do fúzí a akvizic (M&A). Pečlivá daňová due diligence je nezbytná, aby kupující nepřebíral skryté daňové závazky cílové společnosti.

Díky našim zkušenostem z dlouhodobých služeb pro více než 150 akciových společností a 250 s.r.o. nabízíme bezpečné provedení akvizic a revizi smluv, které minimalizují riziko daňových sporů v budoucnu. Zajišťujeme přípravu nebo revizi smluv a vyjednávání smluvních podmínek i v mezinárodním kontextu, čímž chráníme zájmy našich klientů po celém světě.

Kromě přímé právní pomoci využíváme naše rozsáhlé portfolio k podpoře růstu. Pokud klient shání v dané oblasti financování či obchodního partnera pro nákup nebo prodej firmy, vyzýváme jej ke kontaktování kanceláře. Jsme aktivními partnery, kteří klienty propojí mezi sebou, pokud mají zajímavé investiční nebo obchodní příležitosti. I my si rádi poslechneme zajímavé podnikatelské či byznysové nápady.

Rizika absence TCMS a právní řešení od ARROWS

Rizika a sankce	Jak pomáhá ARROWS (Služba + CTA)
Nedostatečná interní kontrola vedoucí k systematickým chybám v daňových hlášeních.	Odborná školení v dané oblasti včetně certifikátu – potřebujete zaškolit tým? Kontaktujte nás na office@arws.cz.
Nesoulad s povinnostmi danými DAC6 u přeshraničních transakcí.	Odborná právní stanoviska a rady k mezinárodnímu zdanění – chcete mít jistotu? Napište nám na office@arws.cz.
Ztráta důvěry u obchodních partnerů a regulátorů kvůli opakovaným daňovým pochybením.	Příprava směrnic a jiné dokumentace, které ochrání před sankcemi – potřebujete právní pomoc? Napište na office@arws.cz.
Selhání v reportingu transakcí (např. DPH) v mezinárodním kontextu (např. SAF-T).	Právní poradenství při získávání povolení a licencí (včetně změn) – potřebujete mít mezinárodní compliance? Napište na office@arws.cz.

Konkrétní finanční hrozby: Penále a úroky

Zjištěné chyby při daňové kontrole vedou k doměření daně, což má pro firmu okamžité a citelné finanční dopady. K doměřené dani se přičítá standardně penále ve výši 20 % z doměřené daně. V případě, že je snižována daňová ztráta, činí penále 1 % z její výše. To jsou náklady, které mohou zásadně ohrozit plánovaný cash flow a ziskovost společnosti.

Kromě penále vznikají také úroky z prodlení, které se počítají od původního data splatnosti daně. Ačkoliv daňový řád umožňuje daňovému subjektu požádat o prominutí těchto úroků, jde o složitý proces, který vyžaduje prokázání ospravedlnitelného důvodu, proč k prodlení došlo.

FAQ – Právní tipy k sankcím

1. Jak mohu minimalizovat riziko 20% penále?
Klíčová je prevence a průkazná dokumentace. Pokud již kontrola probíhá, je nutná silná procesní a právní obhajoba daňového tvrzení. Potřebujete odborná právní stanoviska a rady? Spojte se s námi na office@arws.cz.

2. Jaká je role firemního právníka v kontextu kontroly?
Firemní právníci jsou často partnery advokátní kanceláře ARROWS pro řešení speciálních, vysoce rizikových záležitostí, kde je nutná hluboká expertíza. Naši právníci jsou připraveni vám pomoci – napište na office@arws.cz.

ARROWS: Pojistka odpovědnosti a strategický partner

Vzhledem k tomu, že i jediná chyba v dokumentaci nebo nesprávné posouzení transakce může vést k významným finančním škodám, je pro vrcholový management a investory zásadní mít silnou právní pojistku.

Advokátní kancelář ARROWS je pojištěna na škodu až do 500 000 000 Kč. Tato vysoká pojistka poskytuje našim korporátním klientům nadstandardní finanční jistotu při řešení složitých daňových a právních sporů. Jsme běžně partnery firemních právníků pro řešení speciálních záležitostí, které vyžadují externí expertizu a zastupování u regulátorů.

Klientům poskytujeme komplexní servis včetně zastupování u rejstříků, regulátorů a dohledových orgánů včetně plnění povinností. V daňové kontrole je čas klíčový, a protože ARROWS řeší tuto agendu denně, dokážeme klientovi výrazně zkrátit čas a minimalizovat riziko chyb.

Finanční a procesní sankce při daňové kontrole a ochrana od ARROWS

Rizika a sankce	Jak pomáhá ARROWS (Služba + CTA)
Doměření daně s penále ve výši 20 % z rozdílu.	Zastupování v soudních sporech a správních řízeních – potřebujete obhajobu? Napište na office@arws.cz.
Ztráta daňového odpočtu a s tím spojené sankce.	Příprava nebo revize smluv a vyjednávání smluvních podmínek (ochrana odpočtu) – chcete mít jistotu? Kontaktujte nás na office@arws.cz.
Vznik úroků z prodlení, i když se daná daň dodatečně uhradí.	Právní poradenství při jednání se správcem daně – chcete minimalizovat úroky? Napište na office@arws.cz.
Kontrola přeroste v dlouhotrvající soudní spor.	Zastupování u rejstříků, regulátorů a dohledových orgánů včetně plnění povinností – potřebujete strategického partnera? Spojte se s námi na office@arws.cz.

Závěr: Nestavte svou budoucnost na riziku

Digitalizace daňové kontroly v roce 2026 klade na korporace bezprecedentní nároky na preciznost, dokumentaci a systémové řízení daňové compliance. Finanční správa používá stále sofistikovanější nástroje pro analýzu dat, a proto se riziko finančních postihů zvyšuje. Pokud chcete minimalizovat rizika pokut ve výši 20 % doměřené daně, předejít zdlouhavým soudním sporům a chránit svou firmu silným právním pojištěním, je čas jednat proaktivně.

Advokátní kancelář ARROWS řeší tuto agendu denně, čímž dokáže klientovi výrazně zkrátit čas a minimalizovat riziko chyb. Naše rozsáhlé zkušenosti z poskytování dlouhodobých služeb pro více než 150 akciových společností a 250 s.r.o. a pojištění odpovědnosti do 500 000 000 Kč vám dávají jistotu, že vaše daňová compliance je v nejlepších rukou.

Pokud nechcete riskovat chyby, škody nebo pokuty, svěřte celou věc bezpečně advokátní kanceláři ARROWS – stačí kontaktovat kancelář na office@arws.cz.

FAQ – Nejčastější právní dotazy k digitální daňové kontrole 2026

1. Co je hlavním cílem digitalizace daňových kontrol v roce 2026?
Hlavním cílem je přechod od manuálních kontrol k cílené analýze dat a identifikaci rizikových subjektů pomocí algoritmů. Finanční správa tak zvyšuje efektivitu výběru daní a minimalizuje úniky. 

2. Musím zavádět systém SAF-T, i když není v ČR povinný?
Ačkoli Standard Audit File for Tax (SAF-T) není v ČR plošně zaveden, je to mezinárodní standard OECD a globální trend. Společnosti s mezinárodním přesahem by měly pracovat na interní standardizaci dat, aby mohly snadno generovat strukturované výstupy pro kontrolní orgány a mezinárodní partnery, čímž prokazují připravenost. Potřebujete právní pomoc s datovou standardizací? Napište na office@arws.cz.

3. Jaká je role Důkazního Břemena v digitální kontrole?
Důkazní břemeno stále leží na daňovém subjektu. V digitální kontrole to znamená, že musíte být schopni rychle a průkazně doložit oprávněnost každé transakce elektronickými záznamy a dokumentací, a to ve formátu, který správce daně požaduje.
Chcete vědět, jaké jsou vaše právní možnosti v daňovém řízení? Kontaktujte nás na office@arws.cz.

4. Jak nám pomůže zavedení Tax Compliance Management Systému (TCMS)?
TCMS je aktivní řízení daňových rizik. Pomáhá identifikovat slabé body v procesech, minimalizovat chyby vedoucí k doměření daně, a snižuje pravděpodobnost, že budete Finanční správnou označeni za rizikový subjekt. Je to nejlepší prevence. Spojte se s námi na office@arws.cz a získejte právní řešení na míru v oblasti TCMS.

5. Jsou mezinárodní transakce kontrolovány přísněji?
Ano. Díky směrnicím jako DAC6 (ohlašování přeshraničních uspořádání) a DAC7 (digitální platformy) dochází k automatické výměně informací mezi státy EU. Mezinárodní prvek výrazně zvyšuje komplexnost a kontrolní tlak, který je ARROWS International schopna řešit. Naši právníci jsou připraveni vám pomoci s mezinárodním zdaněním – napište na office@arws.cz.

6. Jak nám pomůže ARROWS při daňové optimalizaci, abychom se vyhnuli zneužití práva (ATAD)?
Poskytujeme odborné právní posouzení plánovaných transakcí. Pomáháme klientům strukturovat daňové optimalizace tak, aby splňovaly nejen formální zákonné požadavky, ale aby obstály i v testu věcné opodstatněnosti a předešly aplikaci Generálního pravidla proti zneužívání daňového práva (GAAR). Pro okamžité řešení vaší situace nám napište na office@arws.cz.

Nechcete tenhle problém řešit sami? Advokátní kanceláři ARROWS věří více než 2000 klientů a jsme oceněni jako Právnická firma roku 2024. Podívejte se ZDE na naše reference a bude nám ctí pomoci vám při řešení vašeho problému. Poptávka je zdarma.